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- CAMPUS dei LICEI - L'AGORA' del
SAPERE - 8/9/2011 ore 10:30
- SeMS – Seminario di Modellazione & Simulazione
Monday February 21, 2011, 9:00 am to 6:45 pm
Seminar Room, Department of Studies on Structures, Roma Tre, Via Corrado Segre,
6 (3rd floor)
A Biophysics Day
In the morning, from 9:00 am on, Lena Rebecca Zastrow and Marco
Ribezzi Crivellari will defend their doctoral theses: "A simplified 1D model
for the chemo-mechanical coupling in sarcomere dynamics" and "A dual-trap
optical tweezer setup for single- molecule manipulations: development and
testing," respectively.
In the afternoon, from 2:00 pm to 6:45 pm, a Mini-Workshop will take place (see
programme below). We are delighted to have as our guest speakers Fabio
Cecconi from INFM-CNR Centre for Statistical Mechanics and Complexity (SMC)
& Istituto dei Sistemi Complessi (ISC-CNR), Rome, Fabrizio Cleri from
Institut d'Electronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie, Université
des Sciences et Technologies de Lille 1, Villeneuve d'Ascq, Cristian
Micheletti from International School for Advanced Studies (SISSA-ISAS),
Trieste, and Massimo Reconditi from Laboratorio di Fisiologia –
Dipartimento di Biologia Evoluzionistica «Leo Pardi», Università di Firenze,
Florence.
- Sono aperte le iscrizioni per il corso "Dinamica Classica per simulazione
di sistemi biologici" (Dott. Alessandro Grottesi, Dott. Giordano Mancini,
Dott. Giovanni Chillemi) che si svolgerà dal 22 al 24 Febbraio presso il CASPUR
(Sala Auditorium, Via dei Tizii 2c, Roma).
Il corso si propone di fornire fornire gli strumenti teorici e pratici per
eseguire simulazioni di dinamica molecolare classica di macromolecole
biologiche, Verranno presentate in particolare le nozioni di base per l'uso
pratico del software di dinamica molecolare Gromacs e gli strumenti per
l'analisi delle traiettorie delle simulazioni ottenute con gli strumenti di
calcolo parallelo del CASPUR.
Al termine del corso lo studente/utente sarà in grado di progettare/eseguire
calcoli HPC di Dinamica Molecolare nell'ambiente di calcolo parallelo del CASPUR
(sia su cluster CPU che GPU) e di analizzare i relativi dati in ambiente UNIX/Linux.
E' richiesta: * Nozioni di base di ambiente Unix/Linux.
Per iscriversi e' necessario compilare il form alla sezione "Iscrizione"
della
pagina del corso
Ricordiamo il calendario dei
corsi organizzati dal CASPUR per il 2011:
* 15 - 18 Marzo 2011: Calcolo scientifico e tecnico in linguaggio C
* 21 - 24 Marzo 2011: Project_Management
* 29 - 31 Marzo 2011: Tool per la scrittura, sviluppo e gestione del software
scientifico
* 19 - 21 Aprile 2011: Introduzione all'amministrazione di sistemi
Linux-Workstation
* 3 - 6 Maggio 2011: Calcolo scientifico e tecnico in linguaggio Fortran95
* 17 - 19 Maggio 2011: Introduzione al calcolo parallelo con MPI e OpenMP
* 31 Maggio - 1 Giugno 2011: Analisi serie storiche con AdamSotf
* 7 - 9 Giugno 2011: Matlab per il calcolo scientifico
* 29 Agosto - 9 Settembre: Scuola Estiva di Calcolo Avanzato
* 20 - 22 Settembre 2011: Introduzione all'amministrazione di sistemi
Linux-Server
* 27 - 29 Settembre 2011: Database per la ricerca biomedica
* 4 - 6 Ottobre 2011: Tecniche di Data Mining per la classificazione
* 18 - 20 Ottobre 2011: Networking
* 25 - 27 Ottobre 2011: Scripting in Python
* 2 - 4 Novembre 2011: GPU programming
* 15 - 17 Novembre 2011: Elementi di amministrazione di un sistema Windows
Server
* 29 Novembre - 2 Dicembre 2011: Calcolo scientifico e tecnico in linguaggio C++
- Il prof. Francesco dell'Isola in visita alla zona rossa dell'Aquila
subito dopo il terremoto
( immagine 1 -
immagine 2 )
