Il Dottorato in Pianificazione Territoriale e Urbana, sin dalle origini (1983) persegue un approccio della formazione alla ricerca basato sull'integrazione delle dimensioni teorica e applicata. L'area di interesse è il governo delle trasformazioni urbane e territoriali (conoscenze, strumenti, politiche, processi, …) sotto i diversi profili che le caratterizzano: le motivazioni di sviluppo socio-economico; la rilevanza del patrimonio culturale (beni e paesaggio); gli aspetti funzionali, spaziali e morfologici; le relazioni con l'ambiente (ecologia e paesaggio); le dimensioni economiche e finanziarie e le implicazioni sociali degli interventi. Il Dottorato offre borse di studio (il bando generalmente è pubblicato nel mese di luglio) e concorre a una borsa della Scuola di Dottorato in Ingegneria Civile e Architettura, riservata a cittadini stranieri (il bando generalmente è pubblicato nel mese di aprile).